乡镇卫生院工作待遇是不错的，乡镇卫生院属于事业单位，执行事业单位工资标准，在乡镇卫生院的基本工资一般都有三千以上，加上绩效工资，年终绩效奖等收入，整体上在乡镇可以过上不错的生活。在乡镇卫生院除了工资还有出诊费，加班费等收入，门诊接诊量大的医生收入更高，有些业务量大的乡镇医院医生的收入是很高的，而且乡镇卫生院的压力也不大。
在乡镇卫生院工作待遇还是不错的。
事业单位工作人员，包括乡镇卫生院的医务人员，目前实行的是事业单位的岗位绩效工资制度。岗位工资是按医务人员职称，由单位聘任相应岗位，根据国家工资政策，套改出基本工资（岗位工位和薪级工资）。
绩效工资是根据单位的收入状况，经当地人社、财政部门核定总量后，基础性绩效工资（占总量的50-70%）按岗位每月随基本工资固定发放；奖励性绩效工资（占总量的50-30%）由乡镇卫生院根据本单位各岗位的艰苦程度和贡献大小，经考核后按单位的奖励性绩效工资分配办法进行发放。
党的十八届三中全会通过的《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》指出：“形成合理有序的收入分配格局。着重保护劳动所得，努力实现劳动报酬增长和劳动生产率提高同步，提高劳动报酬在初次分配中的比重”。
据了解，目前国家有关部门正在抓紧调研，拟出台向基层倾斜、并以基本工资为主的收入分配制度改革政策。另外，乡镇卫生院可通过改善就医疗条件、增加业务工作量等措施增收节支，扩大收入，增核单位绩效工资总量，提高医务人员的收入。